Biologia Molecular e Biotecnologia

Objetivos

Os principais objetivos desta disciplina são os seguintes:

1. Compreender os fundamentos da biologia molecular;

2. Conhecer as principais aplicações da biologia molecular na investigação científica marinha;

3. Conhecer aplicações relevantes das biotecnológicas marinhas (“biotecnologia azul”);

4. Aptidão para aplicar várias técnicas laboratoriais de biologia molecular;

5. Saber utilizar ferramentas bioinformáticas para tratamento de dados moleculares.

Programa

1. Genoma: estrutura e organização

2. O código genético

Replicação - DNA

Transcrição e processamento - RNA

Proteínas: estrutura e regulação

3. Variabilidade genética:

Mutação

Recombinação

4. Genómica: tecnologia, ferramentas bioinformáticas

5. Aplicações da biologia molecular:

Sistemática molecular

Filogenia e filogeografia

Genómica ecológica

Dispersão e conectividade

Genética da conservação

6 Técnicas de biologia molecular:

Métodos de preservação de amostras biológicas

Métodos de extração de DNA e RNA

Amplificação de DNA por PCR

Visualização de fragmentos de DNA por electroforese em gel de agarose

Sequenciação pelo método de Sanger

Construção de bibliotecas transcriptómicas e genómicas para high-throughput sequencing (HTS)

Quantificação da expressão génica por PCR em Tempo Real (qPCR), RNA-Seq

7. Técnicas bioinformáticas:

Análise de sequências de DNA

Inferência filogenética

Ferramentas bioinformáticas para análise de dados de HTS

Métodos de Ensino

Os conteúdos serão transmitidos aos alunos com base em aulas teóricas e teórico-práticas presenciais, de natureza expositiva com recurso a apresentações visuais dinâmicas. Serão usados métodos expositivos e interrogativos para manter a atenção e participação dos alunos.

No final das aulas será disponibilizada a bibliografia mais relevante através da plataforma de “b-learning Moodle”, a qual será também usada de forma assíncrona para esclarecer dúvidas e/ou dar informações complementares. As aulas teórico-práticas serão realizadas nos laboratórios de química e biologia molecular do DOP, que dispõe dos equipamentos necessários para as técnicas básicas.

Bibliografia

Geral:

Griffiths, AJF, Wessler, SR, Carroll, SB & Doebley J (2012). Introduction to Genetic Analysis (10th edition). WH Freeman & Co.

Kratz, R.F. (2009). Molecular & Cell Biology for Dummies. Wiley Publishing, Inc., Indianapolis.

La Barre, S. & Kornprobst, J.-M., Eds. (2014). Oustanding Marine Molecules. Wiley, VCH, Weinheim.

Se-Kwon, K., Ed. (2015). Springer Handbook of Marine Biotechnology. Springer Publ.

Watson, JD, Baker, TA, Bell, SP, Gann, A, Levine, M & Losick, R (2007). Molecular Biology of the Gene (6th edition). Pearson/Benjamin Cummings/CSHL Press).

Será ainda fornecida bibliografia específica sobre o tema de cada aula.

Método de Avaliação

• Componente continuada - 30 %
• Componente sumativa - 70 %